在知网查重中，处理高相似度文献的方法主要包括：1.引用去重，即去除文献中重复引用的部分；2.关键词过滤，通过设定关键词过滤规则，排除相似度较高的文献；3.语义分析，利用自然语言处理技术，分析文档语义，识别相似度高的内容；4.手动排查，通过人工干预，对高相似度文献进行逐一核查。

针对知网查重中的高相似度处理，还可以采用以下方法：1.篇章结构比对，对文档结构进行比对，发现相似度高的篇章；2.引用链分析，通过分析文献的引用链，发现相似度高的论文；3.基于语义的去重，结合语义信息进行文献去重，提高查重效果；4.文本聚类，将相似文献聚类在一起，方便查重和分析。